Ο Γιάννης Πρετεντέρης έχει πραγματοποιήσει δύο γάμους. Η πρώτη του σύζυγος είναι η Φρόσω Ράλλη, όμως την υπόλοιπη ζωή του την περνά στο πλευρό της δεύτερης γυναίκας του, η οποία ακούει στο όνομα Σάντρα Μπακογιαννοπούλου.
Ο δημοσιογράφος, γενικότερα, κρατά την προσωπική του ζωή μακριά από τα φώτα της δημοσιότητας, καθώς σπάνια πραγματοποιεί δημόσιες εμφανίσεις, ενώ δεν μιλά πότε για την οικογένειά του.
Αυτή είναι η σύζυγος του Γιάννη Πρετεντέρη
Εκείνη ήταν ντυμένη κομψά, με μπεζ παλτό και καπέλο, ενώ εκείνος ήταν ντυμένος στα γκρι, με μπουφάν και παλτό. Περπατούσαν κρατώντας ο ένας το χέρι του άλλου και δεν έδιναν σημασία στα βλέμματα που γύριζαν προς το μέρος τους.